Tender "Aplikácia NGS (sekvenovanie ďalšej generácie) na norovírus"
19-06-2018
Tender OC/EFSA/BIOCONTAM/2018/01
Aplikácia NGS (sekvenovanie ďalšej generácie) na norovírus
Termín : 07. 08. 2018 do 14.30 h (CET)
Hlavným cieľom je využívať NGS na identifikáciu a charakterizáciu norovírusov z príslušných zdrojov potravín (napr. kôrovce, mäkkýše, ovocie, zelenina a výrobky z nich), životného prostredia a ľudských prípadov alebo asymptomatických nosičov.
Špecifické ciele tendra:
- vykonať molekulárnu charakterizáciu výberu izolátov norovírusu z rôznych zdrojov (napr. potravín, prostredia a ľudí) využijúc analýzu NGS;
- preskúmať genetickú rozmanitosť a rozšíriť chápanie možných modelov diverzifikácie norovírusu v rámci a medzi rôznymi spomínanými zdrojmi;
- posúdiť epidemiologický vzťah medzi kmeňmi norovírusu z rôznych zdrojov vrátane možnej rozdielnej zmesi genotypov v rámci tej istej matrice a možných prípadov vírusovej rekombinácie;
- vykonať retrospektívnu analýzu kmeňov / izolátov Norovirus epidemiologicky prepojených s epidémiami prenášanými potravinami (ak sú k dispozícii kmene / izoláty z epidémií) s cieľom preskúmať realizovateľnosť NGS ako nástroja na identifikáciu zdrojov a ciest prenosu.
Viac informácií nájdete na webovom sídle: https://etendering.ted.europa.eu/cft/cft-display.html?cftId=3688
